Il "libro segreto" del titolo è il racconto dettagliato della vita tormentata di Grazia dei Rossi, scritto da lei stessa per il figlio. Grazia dei Rossi, figlia di una ricca famiglia ebrea, si innamora di un nobile cristiano e, costretta a scegliere tra la fede e l'amore, sceglie quest'ultimo. Ma il suo promesso sposo scompare e la giovane donna, afflitta e umiliata, sembra destinata a una vita di solitudine finché non incontra un potente ebreo, Judah del Fisigo, medico e consigliere di re e papi. In questo modo Grazia avrà accesso alle corti più splendide d'Europa e scoprirà che il destino le riserva ancora sorprese.